이번 조치로 ▷의료원 산하 센터 및 연구소의 진료기능은 해당병원으로 이관하며, 연구기능은 의과학연구원으로 이관 ▷기초학교실 관련 연구소는 성의교정으로 이관하고 의과학연구원 산하 각 병원 임상의학연구소는 해당 병원으로 이관 ▷각 연구소 및 센터의 편제 조정에 따른 분야별(인사, 재무, 구매, 기타 등) 업무처리는 해당 기관장에게 위임한다는 원칙을 바탕으로 이루어졌다.
의료원산하 10개 연구소 중 7개 연구소가 아래와 같이 각 해당기관 산하로 조정되었으며, 의과학연구원장 산하에 있던 직할병원 임상의학연구소는 각 병원 산하로 편제되었다.
▷성의교정 ; 기생충병연구소, 한센병연구소
▷성모병원 : 산업의학센터, 조혈모세포이식센터, 뇌신경센터
▷강남성모병원 : 가톨릭암센터, 류마티스센터(명칭변경)